（1）标准库管理系统主要是完成相关标准的录入、更新、修改和审核等功能。一套完整的标准库是使整个业务能够流畅运转的根本保障，标准库的内容应该包括标准代码、标准名称、标准类别、项目代码、项目名称、项目标准值、项目标准单位、检验方法、检验科室等必要字段，为了保证标准的准确性，标准库应由资深的专家审核后方可正式使用。
（2）样品管理系统该系统是实验室日常运行最为频繁的模块，它为样品分析评价提供了支持，包括样品分析、样品登录、样品管理、样品测试、审核系统、结果输出、QA/QC等方面。
（3）争议处理系统当用户对分析结果产生质疑时，可以通过争议模块处理争端。LIMS应完整记录样品分析相关信息并具备可追踪性。用户只需通过书面、电话、传真、电子邮件、网上发布等形式提出争议请求，争议处理负责人员将及时响应用户需求。
（4）信息查询系统信息查询：包括分析进度、综合信息查询。用户可根据授权级别查询相关信息。为了迅速从系统中找到所需信息，避免多余信息的出现，用户可进行特定的、自定义查找。所有查询结果都可以进行排序、分类、统计。信息查询可快速反映从原始数据到加工处理数据的每一步历史数据，也能查询人员情况，项目进行情况，客户，标准资料，实验室各种文件规定，各种报表，及各种技术资料等等。信息统计：灵活方便的反映不同用户要求的各类统计图表信息模块。根据需要还可提供与各类专用统计软件的无缝连接。
（5）实验室事务管理系统实验室事务管理系统包括实验室杂务、内部通告、人员去向、计划、工作安排、文档处理、公共信息、人事管理和经费管理等方面。主要从事日常事物处理工作，提供汇总实验室人员、设备、项目以及实验数据，完成各种日常报表编制和实现网上信息采集、整理、检索和数据统计工作。
（6）检测收费管理系统受检样品收费功能：样品受理完成后形成缴费单据（进行过欠费处理的除外），财务科的工作人员根据样品受理时产生的唯一编号进行收费操作。财务收费应包括申请（被采样）单位、缴款方式（现金、支票、电汇）、打折情况、应缴款、实际缴款等字段。n财务管理功能包括会计核算（总帐模块、应收帐模块、应付帐模块、现金管理模块、固定资产核算模块、多币制模块、工资核算模块、成本模块）和财务管理（财务计划、财务分析、财务决策）等模块；系统自动完成凭证记帐、根据定义好的报表格式和公式自动生成报表，而且保证了数据的准确性和一致性，减轻了手工劳动，大大提高了工作效率和工作质量。
（7）科研管理及资料查询系统包括科研立项、过程监控（文档）、阶段试验（报告）、科研档案管理和项目结题等方面。该系统将与单位内部的文献资料信息库集成，方便科研人员的资料查询，提高科研的水平和质量。
（8）资源管理系统资源管理包括人力资源、物力资源、标准物质管理、其它物资管理以及无形资产如知识产权等的管理模块。
（9） 客户关系管理系统由于消费者的消费者意识逐渐加强，顾客已由过去的被动接受，转变为主动寻求自我需求，因此注重满足个性差异的顾客需求将是企业间的竞争趋势。在客户导向的时代，只有积极的个性化服务，才能提高消費者的忠诚度，抓住客户的心。客户关系管理关注的就是如何通过不断的沟通了解并影响顾客的行为，通过分析对顾客有效并可供参考的信息，增加新客户、留住老客户，根据客户的个性化需求提供专为客户量身订做的服务以提高客户的满意度并改善客户的利润贡献度。
（10）系统管理系统系统管理模块是对系统用户进行管理，包括用户设置与编辑、数据查询用户、部门设置与编辑和部门管理等；同时进行资源配置管理和日志管理。n系统管理包括系统初始化、设定用户权限、系统设定、日志管理、论坛管理和数据维护。数据维护是系统维护工作量最大的部分。因为系统每天运行都要产生大量数据，这些数据的有效存储、备份都是很重要的。
（11）内部论坛和公告栏可以按业务种类设置专题论坛，每一论坛有本实验室的这类业务负责人负责，内容涉及该类业务的发展动态、员工的技术交流、专业问题的讨论等；公告栏主要是针对实验室的当前的研究重点、工作活动的安排、主攻的难点、科研计划等进行公告，让员工随时了解本实验室的工作动态，有利于调动员工的工作主动性。（12）帮助系统有独立运行帮助系统，有紧跟具体模块的在线帮助，更有智能化帮助信息（系统自动根据鼠标所处的位置给出相应的帮助信息），全方位的提供帮助信息。
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